Премия «Москва-Пенне» учреждена при участии Союза писателей Москвы, Русского ПЕН-центра, Министерства культуры РФ, Клуба писателей ЦДЛ, Союза писателей России, Русского ПЕН-центра, Литературного института им. А.М. Горького, администрации области Абруццо, администрации провинции Пескара, администрации города Пенне (Италия) и оргкомитета национальной премии по прозе «Город Пенне» (Италия).

Перед церемонией вручения премий проходит публичное обсуждение произведений-финалистов с участием авторов и членов общественного жюри, среди которых студенты различных московских вузов, старшеклассники и самые активные читатели. Обсуждение завершается тайным голосованием и выбором абсолютного победителя. Каждому из трех авторов-финалистов вручается премия в размере 50 000 рублей, лауреату вручается дополнительная премия в размере 75 000 рублей.

Лауреатами премии в прошлые годы стали В. Распутин, Ф. Искандер, Л. Петрушевская, Б. Екимов, В. Токарева, Л. Улицкая, Б. Васильев, Е. Носов, А. Волос, А. Королев, А. Ким, В. Маканин, Г. Бакланов, Ю. Поляков, А. Слаповский, С. Юрский, А. Курчаткин, В. Личутин, И. Волгин, Ю. Пахомов, М. Попов, В. Попов, Ю. Буйда, Ф. Нагим, А. Архангельский, М. Кучерская, М. Левитин, С. Шаргунов,  А. Битов, К. Букша и др.

Торжественная церемония награждения традиционно проходит в Большом зале Центрального Дома литератора. Жюри Премии возглавляет Первый секретарь Союза писателей Москвы Евгений Ю. Сидоров.